פרופ' אמנון אלבק

פרופ'
פרופ'
פרופ' אמנון אלבק
טלפון: 
דוא"ל: 
משרד: 

קורות חיים

דוקטוראט, כימיה אורגנית, מכון ויצמן למדע, 1988.

פוסט-דוקטוראט, ביוכימיה, אוניברסיטת ברנדייס, ארה"ב, 1990.

חבר סגל במחלקה לכימיה, אוניברסיטת בר אילן, מ 1990.

פרופ' מן המנין מ-2008. 

ראש המחלקה לכימיה בשנים 2008-2011.

סגן הרקטור, אוניברסיטת בר אילן, מאוקטובר 2014.

 

חבר ב"מרכז מרכוס לכימיה תרופתית" בבר אילן. 

פירסומים

 

Recent Publications (past 10 years)

 

Ozeri, R.; Khazanov, N.; Perlman, N.; Shokhen, M.; Albeck, A. Enzyme Isoselective Inhibitors: A Tool for Binding Trend Analysis. ChemMedChem 2006, 1, 631-638.

Shokhen, M.; Khazanov, N.; Albeck, A. Enzyme Isoselective Inhibition: Application to Drug Design. ChemMedChem 2006, 1, 639-643.

Patchornik, G.; Albeck, A. A General Approach for Antibody Purification Utilizing [Protein A-Catechol : Fe 3+] Macro-Complexes. Bioconjugate. Chem. 2006, 17, 258-260.

Sredni, B.; Geffen, R.; Duan, W.; Albeck, M.; Shalit, F.; Lander, H. M.; Kinor, N.; Sagi, O.; Albeck, A.; Yosef, S.; Brodsky, M.; Sredni-Kenigsbuch, D.; Sonino, T.; Longo, D. L.; Mattson, M. P.; Yadid, G. Multifunctional Tellurium Molecule Protects and Restores Dopaminergic Neurons in Parkinson’s Disease Models. FASEB J. 2007, 21, 1870-1883.

Brodsky, M.; Yosef S.; Rushkin G.; Albeck M.; Longo D. L.; Albeck A.; Sredni B. The Synthetic Tellurium Compound, AS101, is a Novel Inhibitor of Interleukin-1-beta Converting Enzyme. J. Interferon Cytokine Res. 2007, 27, 453-462.

Shokhen, M.; Khazanov, N.; Albeck, A. The Cooperative Effect Between Active Site Ionized Groups and Water Desolvation Controls the Alteration of Acid/Base Catalysis in Serine Proteases. ChemBioChem, 2007, 8, 1416-1421.

Frei, G. M.; Lebenthal, I.; Albeck, M,; Albeck, A.; Sredni, B. Neutral and Positively Charged Thiols Synergize the Effect of the Immunomodulator As101 as a Growth Inhibitor of Jurkat Cells, by Increasing Its Uptake. Biochem. Pharm. 2007, 74, 712-722.

Yosef, S.; Brodsky, M.; Sredni, S.; Albeck, A.; Albeck, M. Octa-O-bis-(R,R)-Tartarate Ditellurane (SAS) – a Novel Bioactive Organotellurium(IV) Compound: Synthesis, Characterization and Protease Inhibitory Activity. ChemMedChem 2007, 2, 1601-1606.

Belostotskii, A. M.; Albeck, A.; Hassner, A. Asymmetric Induction by a Remote Chiral Substituent – Computationally Determined Stereodifferentiation in Michael Additions of α-Lithiated Allyl Sulfones. Eur. J. Org. Chem. 2007, 29, 4837-4844.

Shokhen, M.; Khazanov, N.; Albeck, A. Screening of the Active Site from Water by the Incoming Ligand Triggers Catalysis and Inhibition in Serine Proteases. Proteins 2008, 70, 1578-1587.

Bechor, Y.; Albeck, A. Exocyclic Vinyl Ethers of Ketofuranosides. Tetrahedron, 2008, 64, 2080-2089.

Mirilashvili, S.; Chasid-Rubinstein, N.; Albeck, A. Optically Active g-Hydroxy Sulfone Julia Reagents for the Synthesis of Peptidyl Olefin Peptidomimetics. Eur. J. Org. Chem. 2008, 20, 3461-3464.

Gellerman, G.; Hazan, E.; Brider, T.; Traube, T.; Albeck A.; Shatzmiler, S. Facile Synthesis of Orthogonally Protected Optically Pure Keto– and Diketopiperazine Building Blocks for Combinatorial Chemistry. Int. J. Pept. Res. Ther. 2008, 14, 183-192.

Perlman, N.; Hazan, M.; Shokhen, M.; Albeck, A. Peptidyl Epoxides Extended in the P’ Direction as Cysteine Protease Inhibitors. Effect on Affinity and Mechanism of Inhibition. Bioorg. Med. Chem. 2008, 16, 9032-9039.

Levinger, S.; Sharabi, Y.; Mainfeld, A.; Albeck, A. Structural and Spatial Considerations in the N,N’-diacyl- and dicarbamoyl Bispidinone Series. J. Org. Chem. 2008, 73, 7793-7796.

Gellerman, G.; Hazan, E.; Kovaliov, M.; Albeck A.; Shatzmiler, S. Synthesis of Orthogonally Protected Optically Pure Ketopiperazine, Diketopiperazine, Ketodiazepane and 3-Aminopyrrolidone Building Blocks for Peptidomimetic Combinatorial Chemistry. Tetrahedron, 2009, 65, 1389-1396.

Shokhen, M.; Khazanov, N.; Albeck, A. Challenging a Paradigm: Theoretical Calculations of the Protonation State of the Cys25-His159 Catalytic Diad in Free Papain. Proteins 2009, 77, 916-926.

Gellerman, G.; Shitrit, S.; Shalit, T.; Ganot, O.; Albeck, A. Phenols - useful templates for the synthesis of bi-functional orthogonally protected dendron building blocks via Solid Phase Mitsunobu reaction. Tetrahedron 2010, 66, 878-886.

Mirilashvili, S.; Chasid-Rubinstein, N.; Albeck, A. Optically Active N- and C-terminal building blocks for the Synthesis of Peptidyl Olefin Peptidomimetics. Eur. J. Org. Chem. 2010, 4671-4686.

Shalit, T.; Albeck, A.; Gellerman, G. A double heteroatom Mitsunobu coupling with amino hydroxybenzoic acids on solid phase: a novel application of the Mitsunobu reaction to form dendron building blocks. Tetrahedron Lett. 2010, 51, 5988-5991.

Traube, T.; Vijayakumar, S.; Hirsch, M.; Uritsky, N.; Shokhen, M.; Albeck, A. EMBM – a New Enzyme Mechanism Based Method for Rational Design of Chemical Sites of Covalent Inhibitors. J. Chem. Info. Model. 2010, 50, 2256-2265.

Shokhen, M.; Khazanov, N.; Albeck, A. The Mechanism of Papain Inhibition by Peptidyl Aldehydes. Proteins 2011, 79, 975-985.

Shokhen, M.; Traube, T.; Vijayakumar, S.; Hirsch, M.; Uritsky, N.; Albeck, A. Differentiating Serine and Cysteine Proteases Mechanism by New Covalent QSAR Descriptors. ChemBioChem 2011, 12, 1023-1026.

Gellerman, G.; Waintraub, S.; Albeck, A.; Gaisin, V. One-Pot Synthesis of Novel Antiproliferative 9-Aminoacridines. Eur. J. Org. Chem. 2011, 22, 4176-4182.

Redko, B.; Albeck, A.; Gellerman, G. Facile synthesis and antitumor activity of novel N(9) methylated AHMA analogs. New J. Chem. 2012, 36, 2188-2191.

Uritsky, N.; Shokhen, M.; Albeck, A. The catalytic machinery of rhomboid proteases. Combined MD and QM simulations. J. Chem. Theory Comput. 2012, 8, 4663-4671.

Cohen, M.; Bretler, U.; Albeck, A. Peptidyl cyclopropenones: reversible inhibitors, irreversible inhibitors, or substrates of cysteine proteases? Protein Sci 2013, 22, 788-799.

Sharabi-Ronen, Y.; Levinger, S.; Ben-Dahan Lellouche, M.; Albeck, A. Anti-neoplastic Activity of 1,3-Diaza-2-functionalized-adamantan-6-one Compounds Against Melanoma Cells. Med. Chem. 2014, 10, 27-37.

Traube, T.; Shokhen, M.; Albeck, A. Application of EMBM for Structure-Based Design of Warheads for Protease Inhibitors. Mol Inf 2014, 33, 36-42.

Traube, T.; Shokhen, M.; Albeck, A. A New Method for Filtering of Reactive “Warheads” of Transition-State Analog Protease Inhibitors. Eur J Med Chem 2014, 77C, 134-138.

Shokhen, M.; Hirsch, M.; Khazanov, N.; Ozeri, R.; Perlman, N.; Traube, T.; Vijayakumar, S.; Albeck, A. From Catalytic Mechanism to Rational Design of Reversible Covalent Inhibitors of Hydrolases. Isr J Chem 2014, 54, 1137-1151.

Gilad, Y.; Firer, M. A.; Rozovsky, A.; Ragozin, E.; Redko, B.; Albeck, A.; Gellerman, G. "Switch off/switch on" regulation of drug cytotoxicity by conjugation to a cell targeting peptide. Eur J Med Chem 2014, 85, 139-146.

Rozovsky, A.; Regozin, E.; Oron-Herman, M.; Albeck, A.; Gellerman, G. Synthesis of novel antitumor carbazole-amonafide structural hybrids. Eur J Org Chem 2015, 1811-1818.

Zats, G. M.; Kovaliov, M.; Albeck, A.; Shatzmiller, S. Antimicrobial Benzodiazepine-Based Short Cationic Peptidomimetics. J Pept Sci 2015, 21, 512-519.

Lapidot, I.; Albeck, A.; Gellerman, G.; Shatzmiller, S.; Grynszpan, F. 1,4-Dihydropyridine Cationic Peptidomimetics with Antibacterial Activity. Int J Pept Res Ther 2015, 21, 243-247.

Redko, B.; Ragozin, E.; Bazylevich, A.; Tuchinsky, H.; Albeck, A.; Shekhter Zahavi, T.; Oron-Herman, M.; Kostenich, G.; Gellerman, G. Synthesis, drug release and biological evaluation of new anticancer drug-bioconjugates containing somatostatin backbone cyclic analog as a targeting moiety. Pept Sci 2015, 104, 743-752.

Gilad, Y.; Noy, E.; Senderowitz, H.; Albeck, A.; Firer, M. A.; Gellerman, G. Synthesis, biological studies and molecular dynamics of new anticancer RGD-based peptide conjugates for targeted drug delivery. Bioorg Med Chem 2016, 24, 294-303.

Lapidot, I.; Baranes, D.; Pinhasov, A.; Gellerman, G.; Albeck, A.; Grynszpan, F.; Shatzmiller, S. E. alpha-Aminoisobutyric acid leads a fluorescent syn-bimane LASER probe across the blood-brain barrier. Med Chem 2016, 12, 48-53.

Uritsky, N.; Shokhen. M.; Albeck, A. Stepwise vs. Concerted Mechanism in General Base Catalysis by Serine Proteases. Angew Chem Int Ed Engl 2016, 55, 1680-1684.

Gilad, Y.; Noy, E.; Senderowitz, H.; Albeck, A.; Firer, M. A.; Gellerman, G. Dual-drug RGD conjugates provide enhanced cytotoxicity of melanoma and non-small lung cancer cells. Pept Sci 2016, 106, 160-171. 

Ragozin, E.; Redko, B.; Tuchinsky, E.; Rozovsky, A.; Albeck, A.; Grynszpan, F.; Gellerman, G. Bio-Labile Peptidyl Delivery Systems Towards Sequential Drug Release. Pept Sci 2016, 106, 119-132.

Silberman, A.; Kalechman, Y.; Hircsh, S.; Erlich, Z.; Sredni, B.; Albeck, A. The anti cancer activity of organotelluranes: potential role in integrin inactivation. ChemBioChem 2016, 17, 918-927.

Levinger, S.; Hirsch, S.; Albeck, A. Lithium Aluminum Hydride Assay Suitable for the Organic Chemistry Laboratory. ChemistrySelect 2016, 4, 756-758.

Gilad, Y.; Waintraub, S.; Albeck, A.; Gellerman, G. Synthesis of novel protected Nα(ω-Drug) amino acid building units for facile preparation of anticancer drug-conjugates. Int. J. Pept. Res. Ther. 2016, 22, 301-316.

Zer-Aviv, P.; Shubely, M.; Moskovits, Y.; Viskind, O.; Albeck, A.; Vertommen, D.; Ruthstein, S.; Shokhen, M.; Gruzman, A. A new oxopiperazin-based peptidomimetic molecule inhibits prostatic acid phosphatase secretion and induces prostate cancer cells apoptosis. ChemistrySelect 2016, 1, 4658-4667.

Silberman, A.; Albeck, M.; Sredni, B.; Albeck, A. The ligand substitution reactions of the tellurium compound AS-101 in physiological aqueous and alcoholic solutions. Inorg Chem 2016, 55, 10847-10850.

 

קורסים

קורסים בעבר ובהווה:

84-205 כימיה אורגנית א׳

84-206 כימיה אורגנית ב׳

84-305 מעבדה בכימיה אורגנית ב׳

84-364 חילוף חומרים משני

84-964 מנגנוני תגובות וקטליזה אנזימטית

84-965 קטליזה אנזימטית: שיטות מחקר, בקרה ופיתוח 

80-236 כימיה אורגנית ב׳ לביולוגים

80-380 ביוכימיה של מערכות אנזימטיות

80-757 מעבדה בכימיה אורגנית לתלמידי pre-med

80-759 כימיה אורגנית ב׳ לתלמידי pre-med

תחומי מחקר

כימיה אורגנית, ביוכימיה, אנזימולוגיה, פיתוח מעכבי אנזימים, ביוכימיה חישובית

 

תחומי מחקר ספציפיים (פרויקטים):

1. סינתיזה אורגנית, פפטידים ופפטידומימטיקה.

2. מנגנוני קטליזה ועיכוב של אנזימים.

3. בדיקת פעילות ביולוגית של חומרים שהוכנו במעבדה ברמת האנזים המבודד וברמה התאית.

4. ביוכימיה חישובית: מנגנונים אנזימטיים, פיתוח כלים מיחשוביים לתכנון תרופות ויישומם.

קבוצת מחקר

 

קבוצת המחקר הנוכחית

 

 

דר׳ שלמה לוינגר, עמית מחקר

דר׳ מיכאל שוכן, עמית מחקר

דר׳ סבטה פורמן, מנהלת המעבדה ועמיתת מחקר

 

נטע אוריצקי, דוקטורנטית

אבינועם איזק, דוקטורנט

קובי וולפמן, דוקטורנט

נוגה קאופמן, מסטרנטית

גולדה חורי, מסטרנטית

רון שוורץ, מסטרנט

 

 

חברי עבר בקבוצת המחקר

 

 

תלמידי מחקר

 

רחל קלימובסקי, M.Sc. (1993)

לימור וייס, M.Sc. (1995)

גרי אליעד, M.Sc. (1995)

שולמית פלוס, M.Sc. (1995)

חנה ויטמן, M.Sc. (1995)

אדוארד רוגצקי, Ph.D. (1998)

שרון קליפר, Ph.D. (1999)

רחל פרסקי, Ph.D. (1999)

נורית פרלמן, Ph.D. (2000)

עודד מרוז, M.Sc. (2000)

סימה מירילשויליi, M.Sc. (2000)

רויטל יפידוף, Ph.D. (2002)

נדיה סילברמן, Ph.D. (2004)

יוסי בכור, Ph.D. (2004)

רחל עוזרי, Ph.D. (2005)

סיגל יוסף, Ph.D. (2005)

סימה מירילשוילי, Ph.D. (2005)

שירה אדלר, M.Sc. (2005)

אלכס מיינפלד, M.Sc. (2005)

נעמה חסיד, M.Sc. (2006)

חני אלגאווי, M.Sc. (2007)

מירי בן דהאן, M.Sc. (2007)

מריאנה קישינבסקי, Ph.D. (2008)

תמר טראובה, M.Sc. (2008)

מיטל כהן, Ph.D. (2008)

נטעלי חזנוב, Ph.D. (2008)

מאיה חזן, Ph.D. (2008)

תמרה ברידר, M.Sc. (2008)

רמי קריגר, M.Sc. (2008)

מרים נקש, M.Sc. (2008)

יששכר גלעדי, M.Sc. (2008)

אבי קליין, M.Sc. (2009)

מרינה קובליוב, M.Sc. (2009)

גלינה זץ, M.Sc. (2009)

צחי שליט, M.Sc. (2009)

מורן גלבוע, M.Sc. (2010)

אוריאל ברטלר, M.Sc. (2010)

יפעת שרעבי-רונן, Ph.D. (2010)

קרן שולץ, Ph.D. (2010)

מירי בן דהאן, Ph.D. (2011)

סגיב ויינטראוב, M.Sc. (2011)

יוסי גלעד, MSc (2012)

מיכל הירש, M.Sc. (2012)

רמי קריגר, Ph.D. (2013)

ענבל לפידות, Ph.D. (2014)

קטי לרמן, Ph.D. (2014)

נעמה רובינשטיין, Ph.D. (2014)

תמר טראובה, Ph.D. (2014)

מרינה ירובוי, M.Sc. (2014)

אלון זילברמן, Ph.D. (2014)

ילנה רוגוזין, M.Sc. (2014)

שירה הירש, M.Sc. (2014)

אלכס רוזובסקי, M.Sc. (2015)

יוסי גלעד, Ph.D. (2016)

צחי שליט, Ph.D. (2016)

אבינועם איזק, M.Sc. (2016)

אילת גדליה-ברמר, M.Sc. (2016)

רותי בורנשטיין, M.Sc. (2016)

מורן מזוז, Ph.D. (2016)

בוריס רדקו, Ph.D. (2016)

מלכי גינצבורג, M.Sc (2016)

 

 

פוסט-דוקטורנטים

 

(נורית פרלמן (2000-2001

(גיא פצ׳ורניק (2004

(סיגל יוסף (2004-2005

Vijayakumar Subramaniam (2008-2010)