פרופ' ירדן טשיל

פרופ'
מרצה בכיר

קורות חיים

ד"ר טשיל סיים את לימודי הדוקטורט במכון וייצמן במחלקה לביולוגיה מבנית (בהנחיית פרופ' יעקב אנגליסטר) בנושא מבנה הקולטן האנושי לאינטרפרון IFNAR2 והקומפלקס שנוצר בינו לבין הליגנד IFNa2. הוא המשיך בעבודת הפוסט-דוקטורט במכון הבריאות הלאומי בארה"ב (NIH) תחת שרביטו של  Dr. Ad Bax באחת הקבוצות המובילות בעולם בתחום חקר החלבונים באמצעות תהודה מגנטית גרעינית (NMR). במהלך עבודה זו אפיין ד"ר טשיל מבחינה מבנית ודינמית את חלבון ה-KcsA, תעלת אשלגן גדולה אשר ממוקמת בדופן התא. חלק משיטות העבודה הנדרשים למחקר זה פותחו בתקופה זו ע"י הקבוצה ב-NIH.

באוקטובר 2007 התקבל ד"ר טשיל במחלקה לכימיה והחל בהקמת קבוצת המחקר בתחום ה-BioNMR, NMR אשר מיושם על מולקולות ביולוגיות גדולות כגון חלבונים או DNA במטרה להבין את המבנה שלהם ואת הבסיס המולקולרי-מבני לפעולתם. ביוני 2008 הושלם תהליך הקליטה של ספקטרומטר מגנטי בשדה 16.4 T (700 MHz) המצויד בגלאי מקורר (cryoprobe) ויכולת משופרת לקליטת אותות 13C. מכשיר זה מאפשר לקבוצת ה-BioNMR ליישם את השיטות המתקדמות ביותר המוכרות בעולם לחקר החלבונים. כיום מונה הקבוצה עוזרת מחקר ושבעה סטודנטי מחקר לתואר שני ושלישי. בשל הצורך בהכנת כמויות גדולות יחסית של חלבונים (מ"ג) למדידות NMR, מושקע מאמץ רב בקבוצה בביטוי חלבונים במערכות חיידקיות, ביולוגיה מולקולרית לאופטימיזציה כל הפקת חלבונים, והפרדתם בשיטות אנליטיות וביוכימיות עד לניקיון מספיק למטרות המדידה. לאחר הכנת דוגמת החלבון מתבצעות מדידות ה-NMR אשר יכולות לספק מידע אודות המבנה התלת-מימדי של החלבון, שינויים בקונפורמציה שלו בטווחי זמן שונים, ולבסוף, לגלות את סודות התפקוד הביולוגי שלו.

פירסומים

    Articles        

  1. Elazari-Shalom, H.; Shaked, H.; Esteban-Martin, S.; Salvatella, X.; Barda-Saad, M.; Chill, J.H.* New insights into the role of the disordered WIP N-terminal domain revealed by NMR structural characterization. FEBS J. Epub ahead of print. doi:10.1111/febs.13174  (*Corresponding author)
  2. Reytblat, I.; Keinan-Adamsky, K.; Chill, J.H.; Gottlieb, H.; Gedanken, A.; Goobes, G. NMR studies of DNA microcapsules prepared using sonochemical methods. Phys. Chem. Chem. Phys. 2015, 17(3), 2235-2240.
  3. Sher, I.;†  Chang, S.-C.;† Li, Y.; Chhabra, S.; Palmer, A.G. III.; Norton, R.S.; Chill, J.H.* Conformational flexibility in the binding surface of the potassium channel blocker ShK. ChemBioChem 2014, 15(16), 2402-2410 – Cover Article. ( †Equal contribution, *Corresponding author)
  4. Elazari-Shalom, H.†; Zazrin-Greenspon, H.†; Shaked, H.; Chill, J.H.* Global fold and backbone dynamics of the hepatitis C virus E2 glycoprotein transmembrane domain determined by NMR. BBA-Biomembranes 2014, 1838(11), 2919-2928. (†Equal contribution; *Corresponding author)
  5. Kamnesky, G.; Hirschhorn, O.; Shaked, H.; Chen, J.; Yao, L.; Chill, J.H.* Molecular determinants of tetramerization in the KcsA cytoplasmic domain. Prot. Sci. 2014, 23(10), 1403-1416. (*Corresponding author)
  6. Fried, S.; Reicher, B.; Pauker, H.M.; Eliyahu, S.; Matalon, O.; Noy, E.; Chill, J.H.; Barda-Saad, M. Triple color-FRET analysis reveals conformational changes in the WIP-WASp actin regulating complex. Sci Signal. 2014, 7(331):ra60. doi: 10.1126/scisignal.2005198.
  7. Guttman, C.; Davidov, G.; Yahalom, A.; Shaked, H.; Kolusheva, S.; Bitton, R.; Chill, J.H.†; Zarivach, R.† BtcA, a class IA type III chaperone, interacts with the BteA N-terminal domain through a globular/non-globular mechanism. PLoS One, 2013, 8(12), e81557. (†Co-corresponding author)
  8. Zazrin, H.; Shaked, H.; Chill, J.H.* Architecture of the hepatitis C Virus E1 glycoprotein transmembrane domain studied by NMR. BBA-Biomembranes, 2014, 1838, 784-792. (*Corresponding author)
  9. Shapira, R.; Rudnick, S.; Daniel, B.; Viskind, O.; Aisha, V.; Richman, M.; Ayasolla, K.R.; Perelman, A.; Chill, J.H.; Gruzman, A.; Rahimipour, S. Multifunctional cyclic D,L-α-peptide architectures stimulate non-insulin dependent glucose uptake in skeletal muscle cells and protect them against oxidative stress. J. Med. Chem. 2013, 56(17), 6709-6718.
  10. Haba, N.Y.†; Gross, R.†; Novacek, J.; Shaked, H.; Zidek, L,; Barda-Saad, M.; Chill, J.H.* NMR determines transient structure and dynamics in the disordered C-terminal domain of WASp interacting protein. Biophys. J. 2013, 105(2), 481-493. (†Equal contribution, *Corresponding author)
  11. Guttman, C.; Davidov, G.; Shaked, H.; Ganguly, A.; Miller, J.F.; Chill, J.H.†; Zarivach, R† Characterization of the N-terminal domain of BteA: a Bordatella Type III secreted cytotoxic effector. PLoS One, 2013, 8(1):e55650. (†Co-corresponding author)
  12. Bermel, W.; Bertini, I.; Chill, J.H.; Felli, I.C.; Haba, N.Y.; Kumar, M.V.; Pierattelli, R. 13C-direct detection amino acid selective NMR experiments to simplify the assignment of IDPs. ChemBioChem, 2012,.13(16), 2425-2432.
  13. Novacek, J.; Haba, N.; Chill, J.H.; Zidek, L.; Sklenar, V.; 4D non-uniformly sampled HabCabCON/intra-HabCabNCO experiments for the sequential assignment and chemical shift analysis of intrinsically disordered proteins. J. Biomol. NMR. 2012, 53(2), 139-148.
  14. Kamnesky, G.; Shaked, H.; Chill, J.H.; The distal C-terminal region of the KcsA potassium channel is a pH-dependent tetramerization domain. J. Mol. Biol. 2012, 418(3-4), 237-247.
  15. Chill, J.H.; Naider, F.N. A solution NMR view of protein dynamics in the biological membrane. Curr. Opin. Struc. Biol. 2011, 21, 627-633.
  16. Chill, J.H.; Louis, J.M.; Delaglio, F.; Bax A. Local and global structure of the monomeric subunit of the potassium channel KcsA probed by NMR. Biochim. Biophys. Acta  2007, 1768(12), 3260-3270.
  17. Ying, J.; Chill, J.H.; Louis, J.M.; Bax A. Mixed-time parallel evolution and multiple quantum NMR experiments: sensitivity and resolution enhancement in heteronuclear NMR. J. Biomol. NMR, 2007, 37(3), 195-204.
  18. Quadt-Akabayov, S.R.; Chill, J.H.; Levy, R.; Kessler, N.; Anglister J. Determination of the human type I interferon receptor binding site on human interferon a2 by cross saturation and an NMR-based model of the complex. Protein Sci., 2006, 15(11), 2656-2668.
  19. Chill, J.H.; Louis, J.M.; Baber, J.L.; Bax A. Measurement of 15N relaxation in the detergent-solubilized tetrameric KcsA potassium channel. J. Biomol NMR, 2006, 36(2), 123-136.
  20. Chill, J.H.; Louis, J.M.; Miller, C.; Bax A. NMR study of the tetrameric KcsA potassium channel in detergent micelles. Protein Sci, 2006, 15(4), 684-698.
  21. Samson, A.O.; Chill, J.H.; Anglister J. 2D-measurement of proton T1ρ relaxation in unlabeled proteins: Mobility changes in a-bungarotoxin upon binding of an acetylcholine receptor peptide. Biochemistry, 2005, 44(32), 10926-10934.
  22. Rozen, O.; Chill, J.H.; Kessler, N.; Mester, B.; Sharon, M.; Zolla-Pazner, S.; Anglister J. Induced fit in HIV-neutralizing antibody complexes: evidence for alternative conformations of the gp120 V3 loop and the molecular basis for broad neutralization. Biochemistry, 2005, 44(19), 7250-7258.
  23. Chill, J.H.; Quadt, S.R.; Anglister J. Backbone dynamics of the human type I interferon receptor, a representative α-helical cytokine receptor. Biochemistry, 2004, 43(31), 10127-10137. (Corresponding author).
  24. Chill, J.H.; Quadt, S.R.; Levy, R.; Schreiber, G.; Anglister J. The human type I interferon receptor: NMR structure reveals the molecular basis of ligand binding.  Structure (Camb.), 2003, 11(7), 791-802.
  25. Samson, A.O.; Scherf, T.; Eisenstein, M.; Chill, J.H.; Anglister J. The mechanism for acetylcholine receptor inhibition by a-neurotoxins and species-specific resistance to a-bungarotoxin revealed by NMR. Neuron, 2002, 35(2), 319-332.
  26. Yao, Y.; Wang, J.; Viroonchatapan, N.; Samson, A.O.; Chill, J.H.; Rothe, E.; Anglister, J.; Wang, Z.Z. The human interferon receptor: Yeast expression and NMR analysis of the extracellular domain of muscle nicotinic acetylcholine receptor alpha subunit. J. Biol. Chem. 2002, 277(15), 12613-12621.
  27. Chill, J.H.; Nivasch, R.; Levy, R.; Albeck, S.; Schreiber, G.; Anglister, J. The human interferon receptor: NMR-based modeling, mapping of the IFN-α2 binding site, and observed ligand-induced tightening. Biochemistry. 2002, 41(11), 3575-3585
  28. Samson, A.O.; Chill, J.H.; Rodrigeuz, E.; Scherf, T.; Anglister, J. NMR mapping and secondary structure determination of the major acetylcholine receptor alpha-subunit determinant interacting with alpha-bungarotoxin. Biochemistry 2001, 40(18), 5464-5473.

 

קורסים

84-102          Inorganic Chemistry       1st year undergraduate          Sun 14-16, Mon 12-14

 

84-997          Magnetic resonance        Graduate                                  Tue 12-14

 

84-887          Biomaterials and              undergradute/graduate         Sun 08-10

                       Biopolymers

 

תחומי מחקר

1. תעלת האשלגן KcsA – תפקוד החלק הציטופלסמי, הבסיס המולקולרי לקישור של מעכבים.

 

2. חלבונים חסרי מבנה – שיטות NMR לאפיון חלבונים אלו והדינמיקה שלהם בקבועי זמן שונים.

 

3. אינטראקציות חלבון-חלבון אשר מפקחות על שינויים ב-cytoskeleton של תאי-T.

 

4. פפטידים ממברנליים – הבסיס המולקולרי לחדירה הויראלית לתוך תאים.

 

קבוצת מחקר

חברי הקבוצה:

 

עוזרת מחקר

ד"ר הדסה שקד

 

תואר שלישי

הדס זזרין-גרינשפן

ענבל שר

עדי הלה-ביקובסקי

אווה שקופ

עדי שנה

נתנאל מנדלמן

 

תואר שני

מתן ניסים

 

בוגרים

הילה שלום אלעזרי (תואר שלישי, 2007-2013)

רננה גרוס (תואר שלישי, 2009-2014)

נועם חבה (תואר שני, 2009-2011)

גיא קמנצקי (תואר שני+שלישי, 2008-2014)

אוראל הירשהורן (תואר שני, 2012-2014)